Os retroelementos específicos do local, como os retrotransposons R2, têm potencial como sistemas programáveis de edição de genoma, mas até agora só foram usados para inserção direcionada em locos genômicos de harbor. Em um artigo agora publicado em NaturezaFell et al. Perfil A evolução das famílias retrotransposon específicas do local para obter informações sobre as preferências do local do alvo, que eles usaram para programentar.
Ao pesquisar 4.464 conjuntos de animais derivados do GenBank, os autores descobriram várias novas famílias de retrotransposon específicas do local, incluindo famílias com múltiplas preferências de integração e com diferentes previsões de 5 ‘e 3’, o que pode indicar mecanismos de redirecionamento. Eles zoaram em um retrotransposon do finch da zebra (Taeniopygia gnttata), chamado R2TGpara perfis bioquímicos e caracterizou sua atividade em células de mamíferos, que mostraram que R2TG Pode inserir cargas úteis por transcrição reversa do RNA e nicking do DNA genômico. Notavelmente, os autores descobriram que R2TG pode ser redirecionado pela engenharia da carga útil, o que permitiu a inserção sem cicatriz da carga útil em novos sites genômicos. A atividade do R2 reprogramadoTG foi aprimorado fundindo -o com CRISPR – CAS9 Nickase.