Mapear medicamentos de pequenas moléculas que se ligam ao DNA ou proteína na cromatina é fundamental para entender sua função. Estudar essas dinâmicas de ligação dentro do cenário epigenético pode melhorar nossa compreensão das ações específicas dos medicamentos para cada tipo de célula. Um artigo em Métodos da Natureza por Dong et al. apresenta o scEpiChem, um método que combina a ligação de medicamentos de pequenas moléculas com o perfil epigenético multimodal em células individuais.
O scEpiChem usa medicamentos de moléculas pequenas biotiniladas capturados com um anticorpo antibiotina, seguidos por marcação direcionada usando proteína A-Tn5 com código de barras e código de barras combinatório. Os autores validaram essa abordagem com três medicamentos de moléculas pequenas: o inibidor de proteína de bromodomínio BET JQ1, o inibidor de CDK7 THZ1 e o inibidor de topoisomerase II doxorrubicina. Eles então incorporaram o perfil de proteína alvo e características epigenômicas, como modificações de histona e acessibilidade de cromatina.
