As toxinas de três dedos são o principal componente do veneno das cobras de elapídeos e têm imunogenicidade limitada em animais produtores de antivenes, o que resulta em uma resposta fraca de anticorpos. Os tratamentos atuais compreendendo anticorpos policlonais, portanto, geralmente carecem de eficácia na prevenção de neurotoxicidade e necrose tecidual. Em um estudo recente publicado em NaturezaTorres et al. Use métodos de aprendizado profundo para produzir proteínas projetadas de novo para neutralizar toxinas de três dedos.
Os autores usaram difusão de Rosettafold (rfdiffusion) para projetar ligantes de proteínas de diferentes subclasses de três toxinas. Essas proteínas impediram a ligação de α-neurotoxinas aos subtipos de receptores nicotínicos da acetilcolina, que de outra forma bloqueariam a neurotransmissão e levariam à paralisia. No caso da citotoxina (um grupo funcional proeminente na família de três toxinas de três dedos), o ligante de proteínas foi projetado para ligar diretamente a toxina, que impedia a desestabilização das membranas fosfolipídicas. Usando a cristalografia de raios-X, os autores mostraram que as estruturas dos ligantes de proteínas no complexo com seus alvos correspondem aos projetos computacionais. Após a validação in vitro dos principais candidatos, os autores desafiaram camundongos com neurotoxinas e mostraram proteção completa quando pré-incubados com os ligantes e quando o fichário foi administrado 15 minutos após um desafio letal de α-neurotoxina em 1:10 (toxina: fichário ) razão molar. Os ratos injetados apenas com ligante não mostraram efeitos negativos até duas semanas após a injeção.
